Микроскопические животные, длина которых редко превышает 1 мм, большинство не достигает 0,3 мм, а личиночные стадии и даже взрослые Echinoderes имеют размеры менее 0,1 мм.
Тело киноринхов явственно расчленено на 13 (реже сегментов, называемых также зонитами, эта сегментация придает киноринхам внешность экзувиев мелких членистоногих, особенно когда голова втянута в покровы тела и животное плавает в жидкости пробы.
Зонит I округлой формы, представляет голову, которая снабжена кругами хитиноидных шипов (скорее крючков), называемых скалидами (III, а); шипы проксимального ряда могут иметь характер сензорных. Зонит II представляет так называемую шею, которая более или менее полностью покрыта поясом хитиновых пластинок — плацид. Остальные зониты образуют туловище, одетое кутикулярным панцирем, который состоит из твердых пластинок, снабженных скульптурой, зубцами, шипами и волосками и придающих туловищу явственно-расчлененный вид, особенно у рода Pycnophyes (I, 6; III, а). Туловище обычно уплощено на вентральной стороне, и в поперечном сечении более или менее треугольно или овально. В передней части головы находится рот, вооруженный венчиком шипов (I, 6; III, в, д, ж). Голова очень подвижна и может быть втянута посредством специальной мускулатуры внутрь туловища; при этом шейные плациды покрывают туловище как бы крышкой, придавая животному вид обезглавленного.
