Кровеносная система замкнутая и состоит из кишечного синуса, спинного, брюшного и кольцевых сосудов. Кроме того, в связи с кожным дыханием развивается густая периферическая сеть мелких сосудов и капилляров. Кровь бесцветна либо окрашена в желтый или красный цвет. Многие оли- гохеты дышат всей поверхностью тела. В редких случаях имеются наружные жабры.
Выделительная система обычно представлена одной парой нефридиев в каждом сегменте тела, но в нескольких передних (ларвальных) они всегда отсутствуют. Иногда число нефридиев сильно уменьшается вплоть до полного исчезновения (роды Paranais и Tubificoides). Строение нефридиев водных олигохет довольно разнообразно (.
Нервная система состоит из надглоточного (головного) ганглия, окологлоточных коннективов и брюшной нервной цепочки. Все части последней парные по происхождению. Органы чувств развиты крайне слабо, глаза имеются только у некоторых олигохет.
