Многочисленные поры и устья, открывающиеся на поверхности тела, соединяют сложно устроенную ирригационную систему губок с внешней средой. Основные типы строения ирригационной системы представляют собой ряд последовательных усложнений в организации губок. Простейшим из них является асконоидная: ирригационная система состоит из гастральной полости, выстланной жгутиковыми воротничковыми клетками, многочисленных пор и устья. Дальнейшее усложнение ирригационной системы идет за счет образования в стенках тела губки радиально расположенных жгутиковых камер, окружающих в один слой гастральную полость, и приводящих каналов. Первый и второй (сиконоидный) типы строения ирригационной системы характерны для большинства представителей отряда Calcarea. Лейконоидный тип строения ирригационной системы отличается наличием жгутиковых камер и системы отводящих и приводящих каналов. По этому типу построена ирригационная система четырехлучевых, кремнероговых и некоторых известковых губок.
Большинство губок снабжено минеральным скелетом. Общий план строения скелета и состав скелетных элементов являются важными систематическими признаками.
