У Errantia жабры расположены попарно на большинстве сегментов, тогда как у Sedentaria они преимущественно концентрируются на одном или нескольких передних сегментах тела. Иногда, впрочем, и у седентарных полихет жабры имеются на многих сегментах. Форма жабр весьма разнообразна.
Органами выделения у многощетинковых червей являются сегментарные органы, или нефридии, в большинстве случаев являющиеся типичными метанефридиями с широкими мерцательными воронками. Они расположены
попарно во всех или в нескольких сегментах туловища (у большинства сидячих полихет нефридии сохраняются лишь в некоторых передних сегментах). Воронка находится у задней стенки сегмента, а канал нефридия проникает в следующий сегмент, делает несколько петлеобразных извивов и открывается наружу порой (нефропором) с брюшной стороны у основания параподии.
Выделительная система у более примитивных Phyllodocidae, Nephthy- didae, Glyceridae и некоторых других семейств представлена протонефридия- ми с соленоцитами.
